Podpisy genów stromalnych w chłoniakach wielkokomórkowych cd

Nie przeprowadzono żadnej wcześniejszej analizy przeżycia ani analizy podgrup z grupami walidacyjnymi (tj. Kohortami MMMLNP CHOP i R-CHOP). Model Cox został wykorzystany do identyfikacji genów związanych z przeżyciem i do zbudowania modeli przetrwania wielowymiarowego. Modele i związane z nimi współczynniki skalowania zostały ustalone, w oparciu o grupę szkoleniową CHOP, a następnie ocenione w grupach walidacyjnych. Wszystkie zgłaszane wartości P są dwustronne, z wyjątkiem tych w grupach walidacyjnych, które są jednostronnymi wartościami P w kierunku obserwowanego wpływu na grupę treningową. Wartości P zgłoszone dla związków przeżycia były oparte na testowaniu pojedynczej hipotezy, z wyjątkiem tych do testowania modeli wielowymiarowych obejmujących sygnaturę centrum zarodkowego B, podścielisko-1, proliferację i MHC klasy II w kohorcie R-CHOP, które były nie dostosowany do wielokrotnego testowania. Aby odkryć nowe sygnatury związane z przeżyciem, wybraliśmy pojedyncze geny o wzorach ekspresji, które znacząco przyczyniły się (P <0,01) do związku przeżycia w grupie treningowej CHOP, w modelu zawierającym ten gen i komórkę B zrębu i zrębu podpisy. Zorganizowaliśmy te geny poprzez hierarchiczne grupowanie zgodnie z ich poziomami ekspresji w grupie szkoleniowej CHOP i zidentyfikowaliśmy pięć grup genów o ekspresji koordynowanej (r> 0,6). Dla każdej z tych pięciu kandydujących sygnatur uśredniano poziomy ekspresji genów składowych i sprawdzono, czy średnia dla podpisu dodana do przewidywanej istotności modelu przetrwania dwuwymiarowego dla grupy szkoleniowej CHOP. Jeden podpis był wyraźnie lepszy od pozostałych w odniesieniu do jego predykcyjnego wkładu w model przetrwania i został wybrany do dalszej analizy. Podpis ten dodał również znaczenie predykcyjne modelu dwuwymiarowego dla kohorty R-CHOP (P = 0,001) i dla kohorty MMMLNP CHOP (P = 0,011) (rysunek 8B i 8C w Dodatku uzupełniającym). W tych modelach przeżycia ta nowa sygnatura była związana ze zmniejszonym przeżyciem, podczas gdy sygnatura zrębu-1 wiązała się ze zwiększonym przeżyciem, mimo że te dwie sygnatury były skorelowane ze sobą (r> 0,8). Dlatego, aby udoskonalić ten nowy podpis, zidentyfikowaliśmy geny, które były z nim silniej skorelowane niż z sygnaturą zrębu-1 (P <0,02) w grupie szkoleniowej CHOP, i zorganizowaliśmy te geny w trzy sygnatury przez hierarchiczne grupowanie, jak opisano powyżej. Sygnatura, która najbardziej poprawiła model przeżycia (stromal-2) została wybrana do dalszych analiz.
Wyniki
Wielowymiarowy model przetrwania
Tabela 1. Tabela 1. Charakterystyka kliniczna pacjentów z rozlanym chłoniakiem z dużych komórek B leczonych za pomocą R-CHOP. Ryc. 1. Ryc. 1. Predyktory ekspresji genów przeżycia u pacjentów z rozlanym chłoniakiem z dużych komórek B leczonych R-CHOP. Przedstawiono wyniki Kaplana-Meiera dotyczące bez progresji i całkowitego przeżycia. Panel A pokazuje, że pacjenci z chłoniakiem rozlanym z dużych komórek B zarodkowym-ośrodkiem B mieli większe prawdopodobieństwo przeżycia wolnego od progresji (po lewej) i całkowitego przeżycia (po prawej) niż pacjenci z aktywowanym roz- Chłoniaka-B-komórkowego
[podobne: dentysta rzeszów cennik, cena rezonansu magnetycznego, dyżury aptek wronki ]